استجابة لتوجه الدولة لتشجيع مؤسساتها لتنمية مواردها ذاتيًا تم الموافقة على إنشاء مجلس أعلى للمراكز. وتتمثل رسالة هذا المجلس في تقوية دور المراكز والوحدات من خلال:
•    دعم المراكز والوحدات وخدماتها المختلفة والمساهمة في توفير احتياجاتها الفنية والمالية والبشرية. وإدخال الجودة في مجال البحث والخدمات وتطبيق معايير الملكية الفكرية
•    المشاركة في تسويق المراكز والوحدات وأنشطتها وأعمالها محليًا ودوليًا.
      وتتمثل آليات المجلس فـي :
     •    عقد الدورات التدريبية والتي تلزم كوادر المراكز والوحدات.
     •    الاتصال بالجهات المختلفة المحلية والدولية للتعريف بالمراكز والوحدات وتسويقها.
     •    إعداد المواد الدعائية  للمراكز والوحدات والاستفادة من قنوات الجامعة الفضائية وخلافه. 
     •    تسهيل والمساهمة في عقد الاتفاقيات المحلية والدولية لتسويق المراكز والوحدات.
     •    دعم التكامل بين المراكز بعضها البعض وبينها وبين المؤسسات والجهات خارج الجامعة.
     •    تطوير نظام  تكنولوجي يضم قواعد بيانات ومواقع إلكترونية للمراكز والوحدات.
     •    المشاركة في المؤتمرات والمعارض والأنشطة المحلية والدولية وتمثيل المراكز والوحدات بها

وعلى مدار السنوات الماضية قامت المراكز والوحدات التابعة لجامعة القاهرة ببحوث ودراسات مثمرة، كانت نموذجاً لما يمكن أن تقوم به الجامعة لخدمة المجتمع وتنمية البيئة، ولخدمة المجتمع بمؤسساته وهيئاته المتنوعة، ولا شك أنها تستطيع أن تعطى المزيد في السنوات القادمة، الأمر الذي يحتم دعمها لانفتاح أكثر على وزارات الدولة ومؤسساتها، للاستفادة من نشاط هذه المراكز والوحدات .