يتكون مبنى مستشفى قصر العينى التعليمى الجديد من 12 طابقا تضم 1200 سرير، ويمثل الدور الثامن والتاسع منها قسم العلاج بأجر، ويعد المستشفى طفرة فى عالم الطب إذ تم تصميمه وتزويده بأحدث الأجهزة والمعدات الطبية فى العالم وهو يمثل علامة بارزة فى إنجازات جامعة القاهرة، والمستشفى تضم أقسام الأمراض الباطنة العامة وتشمل ثمانية أقسام، وأقسام الجراحات الباطنة العامة وتشمل ستة أقسام، والجراحات المتخصصة وتشمل خمسة أقسام والوحدات الطبية المعاونة (الرعاية المركزة – بنك الدم – وحدة المناظير)، والمعامل المركزية، وقسم الأشعة التشخيصية، ووحدة العمليات الجراحية : وتتكون من 18 غرفة عمليات مزودة بكافة الخدمات اللازمة لها من غرف التعقيم والتخدير والإفاقة مزودة بكافة أنواع الميكروسكوبات الجراحية، وأجهزة الليزر، والأشعة التشخيصية ويمكن تخزينها على أجهزة الفيديو.خدمات المصاعد الكهربائية : يوجد 27 مصعدا كهربائيا بالمستشفى لخدمة المرضى والزوار ونقل الأغذية والأدوات وهذا يتيح الحركة للعاملين بالمستشفى بسهولة وبسرعة.

أولا: أقسام الأمراض الباطنة العامة وتشمل ثمانية أقسام.

ثانيا: أقسام الجراحة العامة وتشمل ستة أقسام.

ثالثا: الجراحات المتخصصة وتشمل خمسة أقسام.

رابعا: الوحدات الطبية المعاونة (الرعاية المركزة – بنك الدم – وحدة المناظير).

خامسا: المعامل المركزية.

سادسا: قسم الأشعة التشخيصية.

وحدة العمليات الجراحية:

وتتكون من 18 غرفة عمليات مزودة بكافة الخدمات اللازمة لها من غرفة التعقيم والتخدير والإفاقة، مزودة بكافة أنواع الميكروسكوبات الجراحية وأجهزة الليزر، والأشعة التشخيصية ويمكن تخزينها على أجهزة الفيديو.

ويعتبر هذا المستشفى من أحدث المستشفيات فى مجال التشخيص والعلاج.